A ideia é que a universidade trabalhe com o Bacharelado Interdisciplinar (BI), modelo em que o estudante escolhe entre quatro áreas de atuação: Artes; Humanidades; Saúde; Ciência e Tecnologia. O BI tem duração de três anos e, após conclusão, o aluno poderá fazer a escolha de se graduar em algum curso específico. O projeto prevê que os alunos façam os cursos por meio de colégios universitários, que deverão ser instalados nos municípios.
Estima-se vagas de emprego josapar pelotas que serão acrescidos cerca de R$ 100 milhões por ano, nas regiões Sul e Extremo Sul do Estado, a partir do pleno funcionamento da instituição até 2020. Além disso, serão criadas nove mil vagas em aproximadamente 50 cursos universitários de graduação e pós-graduação.